Presveta Bogorodica rekla je Lusiji da tu, treću poruku, papa smije objaviti tek 1960. godine. Nadbiskup od Larryja dobio je treće proročanstvo tek 1944. godine i to u zapečaćenom pismu koje je vlastoručno napisala mala Lusija. On je pismo poslao u Vatikan tek 13 godina kasnije.
U kolovozu 1959. godine otvoreno je zapečaćeno pismo, a papin tajnik pisao je o tome francuskom piscu Žaku Valeu sljedeće: ‘Otvaranje je obavljeno iza zatvorenih vrata, ali ja sam gledao kardinale prilikom izlaska iz papine kanselarije.
Na njihovim licima bio je vidljiv izraz velikog straha, a kada sma jednog od njih, koga sam dobro poznavao, upitao o čemu se radi, on me je samo odgurnuo i produžio dalje. Izgledao je ako da je upravo ugledao utvaru. ‘ Što je izazvalo toliko uznemirenje crkvenih velikodostojnika?
Treće proročanstvo, tajna iz Fatime, svojevremeno se ubrajalo u najčuvanije dragocjenosti Svete stolice. Poruka je čuvana u najsigurnijim trezorima Vatikana, a tek je papa Ivan XXIII skinuo s nje pečat tajne. To se dogodilo 13.maja 1960. godine. Svjedoci tvrde da je papa, dok je čitao tajanstveno proročanstvo, izgledao smrtno blijed. Nakon toga, proročanstvo je ponovno zaključano.
Papa Ivan Pavao II bio je tijekom boravka u Njemačkoj upitan što zna o Trećoj tajni iz Fatime. Odgovorio je: ‘Svakom će biti dovoljan Krist, bude li imao na umu sljedeće: kada budete čitali da su oceani preplavili cijele kontinente, da ljudi umiru iz minute u minutu, i to na milijune, tada zaista neće više nitko željeti objavljivanje sadržaja tajne poruke . ‘
Tako je, iz straha od panike, ostalo tajna ono što bismo svi morali znati. Već 1958. godine svjetski poznati katolički teolog Karl Rahner izjavio je kako ne može razumjeti da bi ‘Bog određene, a za cijeli svijet važne poruke, povjerio isključivo jednoj osobi, koja bi trebalo da je drži zaključane u ladici, dok se ne ispune.’
Papa Ivan XXIII želio je s trećim proročanstvom iz Fatime budu upoznati vodeći državnici velikih sila, jer je vjerovao da bi njegov sadržaj više od bilo čega utjecao na prekid nuklearnih pokusa u vojne svrhe.